Predomina en Navarra la sustitución frente a la redención porque resulta más económica. Para la
realización de la sustitución se mandan Comisionados a distintas provincias limítrofes para su
contratación.
Durante el periodo 1841-1848, no quedó regularizado el sistema de quintas, produciéndose
continuos enfrentamientos entre el Gobierno y la Diputación, sobre la interpretación del artículo
15º de la ley de Modificación de Fueros, haciendo prevalecer cada uno de sus derechos.
Este enfrentamiento se debe al gran rechazo que provocan las quintas, convirtiéndose en bandera
política contra la Diputación liberal por parte de los progresista y de los carlistas. Provocan una
fuerte desestabilización política y social, uniéndose el agravio comparativo, que sufre Navarra
respecto a las Vascongadas, declaradas exentas a las quintas militares, mientras que Navarra no.
En septiembre de 1841, la Diputación aprueba su propio reglamento de quintas. Éste es diferente
al que se aplica para el resto del Estado, dando libertad a los pueblos para cubrir el cupo como
estimase conveniente.